复旦大学附属中山医院呼吸与危重医学科（以下简称呼吸科）是由我国著名肺病学家、防痨事业奠基人之一吴绍青教授于上世纪30年代创立的肺科发展而来。20世纪40年代积他极推动结核病防治，自主研发国产异烟肼；20世纪50年代末在国内最早开展呼吸衰竭诊治，建立了国内第一个呼吸监护室；1954年建立国内第一个肺功能实验室，1956年自行研制国内首台肺功能仪。

    在复旦大学医院管理研究所连续七年发布的“中国最佳医院专科汇总排行榜”中，中山医院呼吸科一直位列前茅、华东地区榜首。先后入选上海市医学重点学科（2004年）、上海市重点学科（2007年）、上海市重中之重重点专科（2012年）、卫生部临床重点专科（2012年）、上海市强主体临床重点专科（2018年）、并兼管上海市呼吸内科临床质控中心工作，是上海市呼吸病研究所和复旦大学呼吸病研究所挂靠单位，并曾作为上海市院内感染质控中心挂靠单位，推动全市呼吸科相关规范化诊断和治疗工作的开展。

    近年来，中山医院呼吸科在已有优势基础上，形成呼吸危重症、慢性气道病、肺部感染、肺部肿瘤与介入、间质性肺病等五大工作重点和特色，在呼吸衰竭、机械通气、胸腔镜介入诊疗、肺癌多学科诊治、慢性阻塞性肺疾病、器官移植和免疫抑制宿主的肺部感染、医院获得性肺炎、急性呼吸窘迫综合征（ARDS）、肺癌早期诊断与治疗、物联网医学、肺功能测定标准化与质量控制等方面取得多项重要成果。

    中山医院呼吸科已建立临床微生物、呼吸生理、细胞分子生物学、生物物理、物联网医学等五大实验室，也是上海市肺部炎症与损伤重点实验室，上海市呼吸物联网医学研究工程中心挂靠单位。承担多项国家自然科学基金（包括重大、重点项目），国家攻关课题，卫生部基金，科技部重点研发，科技部973子课题、重大专项子课题、教育部基金、上海市科委基金项目重大项目、上海市自然科学基金、各类人才基金以及美国NIH的RO1项目，总金额5000余万元。并与国内外学术机构建立密切合作，取得系列科技成果，包括国家科技进步二等奖（排名第二），卫生部、教育部成果奖项8项，上海市级成果奖项10项。获得专利数十项，部分已完成成果转化。发表论文千余篇，SCI收录论文500余篇，包括Lancet, JAMA-Internal Medicine, AJRCCM, Chest等领域顶级杂志。牵头国际和国内指南17部，编写和出版了大量教材和专著，其中机械通气、临床肺功能相关专著为业内经典书籍，在全国具有引领作用。

    中山医院呼吸科为国内首批博士学位授予点、博士后流动站之一，现有博士生导师8名。2013年成为上海市首批呼吸内科专科医师规范化培训基地，2018年成为首批呼吸与危重症医学（PCCM）专科医师培训示范基地。每年定期举办包括国际呼吸病论坛（ISRD）、中山呼吸论坛、机械通气、肺功能、肺部感染、肺癌和介入技术、睡眠呼吸疾病等学术会议，吸引国内外医师参会数千人次。

     2016年10月，位于西院区9号楼的呼吸科新病房正式启用。目前拥有核定床位200张，其中3个普通病区（总病床114张），1个ICU（病床15张）， 1个急诊留观病区（病床35张），1个老年病区（病床30张），1个睡眠监测病区（病床6张），年住院患者1.77万。除普通及专家、特需门诊外，呼吸科还开设了18项专病门诊，涵盖：慢性阻塞性肺疾病、哮喘、肺部感染及真菌疾病、睡眠呼吸障碍、慢性咳嗽、高原旅游、肺癌靶向治疗、肺癌免疫治疗、戒烟雾霾及相关疾病、支气管扩张、气管镜及介入呼吸病诊疗、肺结节、肺部肿瘤、肺栓塞、呼吸过敏性疾病免疫治疗、淋巴管平滑肌瘤等。年门诊量26万余人次，专病门诊量近3万人次。是面向全国的呼吸危重症及疑难疾病诊治中心，也是国家区域医疗中心对口支援输出单位。

    中山医院呼吸科不仅名家辈出，且已形成一支经验丰富、技术全面、精益求精、团结进取的医疗团队，目前有在职医师53人，其中正高（主任医师/教授/研究员）14名、副高（副主任医师/副教授）9名、主治医师24名、住院医师5名；研究人员4人；技术人员12人。平均年龄41岁，2/3以上医师有博士学位。团队成员有上海市教委特聘教授，东方学者，上海市领军人才，浦江人才，上海市公共卫生优秀人才，扬帆计划等。